先週から、新しい実験を先生に任されました。それは先生の研究室と附属病院の研究プロジェクトの一環で1000個ぐらいの検体の細菌を同定するというプロジェクトです。そう私が任されたの仕事は菌種同定です。先週からほぼ毎日ひっきりなしに、附属病院から、検体の細菌がBAP(Blood Agar Plate)でうちの研究室に届けれています。これから附属病院から送られてきた千個ぐらいの検体の細菌の菌種同定をすることです大体なワークフローはこうです。 1.細菌を超音波処理して細菌の細胞を破砕する。ソニケーション。 2.細菌の16sリボソームRNAの塩基配列をPCRによって増幅させる。 ３.PCR産物をバイオテクノロジー会社に送ってシーケンシングを委託する。 ４.シーケンシングのデータをもとに塩基配列を調べる ５.米国NCBI(National Center of Biotechnology Information)のデータベースにアクセスして調べた塩基配列を細菌の16sリボソームRNA塩基配列のデータベースと照合する。それでどの細菌なのかがわかる。 ６.菌種同定の結果を実験ノートとレポートに書く。 ほぼ毎日十何個もの検体の細菌が送られてきています。写真はその一部です。少し大変ですが、頑張るしかありません😊

ThermoFisher Scientificのオンライ学術演説。ふと見かけたんですが、今週アメリカのバイオテクノロジー会社のThermoFisher Scientificのオンライ学術演説が２つあります。共有します。 １つ目が明後日３月20日（水曜日）日本時間午前11時から午後13時40分までです。 タイトルは”Technology and process advancements in cell and gene therapy development" です。細胞と遺伝子治療に関する演説のようです。 申し込みリンクはこちら（英語）https://www.labroots.com/ms/virtual-event/technology-process-advancements-cell-gene-therapy-development/agenda?cid=tw-corp-0so-org-fb-0-ev-CGTwebinar 2つ目が３月2１日（木曜日）日本時間午後13時から午後14時35分までです。 タイトルは”OncomineWorld 2024" です。次世代シーケンシング（NGS,Next Generation Sequencing）に関するオンラインミーティングのようです。 申し込みリンクはこちら（英語） https://www.labroots.com/ms/virtual-event/oncomineworld-2024 どちらも、今週にそして英語で行われると思います。詳しいアジェンダはどちらも、リンクにアクセスしたら見られます。興味のある方は参考にしていただければと思います。

Online Academician Forum 少し、専門的な話ですがさっき、職場の大学がOnline Academic Forum (https://spotlights.cmu.edu.tw/academicforum.php) でオンライン学術演説を行いました。私はA journey from tyrosine to histidine phosphorylation:Uncovering new cancer mechanism(チロシンからヒスチジンへのリン酸化の旅:新たながんの仕組みを発見)??という演説のタイトルに目を引かれてさっきオンライン演説に参加しました。 英語で行われていましたが講師はイギリス人でケンブリッジ大学出身でタンパク質のリン酸化と機能を研究しているトニー・ハンター(Tony Hunter)先生です。 私が理解している部分を噛み砕いて分かち合います。 生体内のタンパク質のリン酸化は主にセリン(Ser),トレオニン(Thr)そして、チロシン(Tyr)という3つのアミノ酸に多く見られます。(どれも、OH group 水酸基、ヒドロキシ基がついているから)タンパク質のリン酸化は遺伝子や他のタンパク質の機能を調整したり、生体内のいろいろな生化学反応に関与しています。また、セリン、トレオニン、チロシンのリン酸化も膵臓がんなど、がんの発生にも関与していることがすでにわかっています。 ハンター先生の研究によると、稀にヒスチジン(His)のリン酸化が細菌などの原核生物や哺乳類などの真核生物の生体内に存在すると言います。 ヒスチジン(His)の化学構造式: https://jglobal.jst.go.jp/detail?JGLOBAL_ID=200907042120104149 ヒスチジンのリン酸化はヒスチジンの環状部分の２つの窒素(N)のどちらでもリン酸化が可能です。それぞれ1-リン酸化ヒスチジン、と、３-リン酸化ヒスチジン　になります。(それぞれ英語で略したら、1-pHisと3-pHisになります)。リン酸化ヒスチジンはどちらも構造上不安定ですぐに他の物質と反応してしまうので、生体内に稀に見られるわけです。 ハンター先生はリン酸化ヒスチジンに対する特殊なモノクローナル抗体を使ってリン酸化ヒスチジンのタンパク質を研究したら、特定のがん細胞にリン酸化ヒスチジンのタンパク質が著しく見られることがわかりました。ハンター先生の研究で肝臓がん、乳がん、神経芽細胞腫においてリン酸化ヒスチジンのタンパク質が多く見られるそうです。 リン酸化ヒスチジンの(タンパク質の)研究はまだ多くの謎が残っています。リン酸化ヒスチジンは健康な生体内でどんな働きをしているのか、1-pHisと３-pHisの働きは何がどう違うのかがまだ明らかになっていないそうです。 また、特殊ながんについてタンパク質のヒスチジンのリン酸化を抑制することができれば新たながんの治療法の開発につながるかもしれないとハンター先生は話していました。 細菌の実験をしている私にとっても少し難しい内容ですがとても興味深いです。英語もせめて少し論文が読めるようになるくらい勉強しないと。

【ゲーム理論】"ジャンケンで最も勝ち越す方法" から学ぶ、エクスプロイト（搾取）戦略 私の研究対象であるポーカーの関連トピックスとして「ゲーム理論」に関するお話をさせていただきます。 例として「ジャンケン」について考えてみましょう。 理論的に、 ジャンケンで全く隙の無いプレイは グー、チョキ、パーを同じ頻度（約33.3%ずつ）でランダムに出すことです。 このような"均衡"のとれた戦略の相手を負かすことはできません。 では、 グー、チョキ、パーを 34.0%、33.0%、33.0% で出すプレイヤーに対して最大限勝ち越す戦略（各手の頻度）はなんでしょうか。 ぜひ一度答えを考えてみてください。 答えは... グー、チョキ、パー 0%、0%、100%　です。（当たりましたか？） パーを出した際の期待値（勝率）が最も高くなるため、すべてパーにすることで利益を最大化することができます。 このように、均衡プレイから外れたプレイに対して利益を最大化するプレイ戦略のことを「エクスプロイト（搾取）戦略」といいます。 今回の例の面白いところは「隙の無い戦略」は各手を同じ頻度で出すものである一方、「隙のある相手から最大限搾取する戦略」は大きく偏ったものになるところにあります。 たとえばポーカーはジャンケンよりも複雑なゲームですが、今回の例のように相手の隙を突いていく点では同じ観点から戦略を組み立てたりします。面白いです〜 以上、ゲーム理論（とポーカー）の紹介でした〜 （今回の投稿、こちらで適切だったでしょうか。もしずれてたら教えてください...！）

マウスは雑食だけど、チョコみたいな刺激物はある程度慣れさせないとすぐには食べない（個体差があります）

ポリ袋を引っ張ると白濁するのは、分子構造が延伸されて結晶化度が上昇するからである。

ポリカーボネートも、実は界面共重合で作れるらしい。

固い接着剤はせん断に強く、やわらかい接着剤は剥離に強い エポキシ樹脂の架橋率とせん断接着強度及び剥離接着強度のグラフなんかはネットでも引っかかったはず。

ナイロン自体の発明は1935年のことだが、演示実験でよく行われる「界面重縮合法によるナイロン合成」は1958年に発表されたもの。 高校化学で習う「アジピン酸＋ヘキサメチレンジアミン」での合成は高温が必要なため、室温で反応が進行する「塩化アジポイル＋ヘキサメチレンジアミン」による界面共重合法が使われる。

うちのESRは上司が大好き 生き物じゃない機械。。。なのに。。。 もともとその機械は上司の部屋にあり、重量機械なので、震災後一階におろし上司とは離れ離れ。 不調になって色々再起動とかしてもどーしよーもなくなり上司を呼ぶと部屋のドアノブ触っただけで動き出すとか。。。 果ては上司の身分証の写真があるからこれ貼っとけと魔除けばりに貼ったら本当にしばらく調子いいとか。。。ある機械。 他大学とか他の科の先生が使いに来ると男性のときは調子そんなに悪くないのに女性だと必ず調子悪くなる。。。 とかとか絶対この子女の子でしょと思うことしばしば。 役に立たないけどうちの機械使うには知っとくといいトリビア？？ 機械って性格ないはずなのに、癖ありますよねー。

マウスはREM睡眠中、耳がぴくぴく動く （個体差はありますが）

メカニズムは調査中ですが、RNA分解酵素がバイオフィルム分解に効果的。 誰か研究支援してくれないかなー笑

「誰かと」天体観測する時は、レーザーポインターがあるとどの星を指してるかすぐに共有できて便利……こんなのでいいのかな？

ウイルスには運動性はないが、細菌には運動性があるものとないものがある。

鶏やうずらは、羽を交差させてひっくり返し机に置くと自重によって羽を動かせなくなりおとなしくなる。