co-LabBRAINS

交流広場

生命科学系、とくに遺伝子解析を行っている/いた学生・研究者・社会人の方、ぜひ試して感想送っていただけたら嬉しいです!
ご協力ください!

こちら、本日ラボブレで紹介ページ公開した、東大発・無料ソリューションです。

"文献中の実験記述と機械学習を利用した実験検索・提案システム『LEXAS』"
どんな機能?・開発の背景など↓
https://lab-brains.as-1.co.jp/document/download/2023/12/56801/

↓の2つの機能があるようです。

①実験検索機能
遺伝子名で検索して、「該当する実験の一覧」が表示

②実験提案機能
遺伝子名で検索して、「次の実験の対象」として提案される遺伝子の一覧が表示



LEXASページを直接見に行くリンク↓
https://lexas.f.u-tokyo.ac.jp/

2件のコメント (新着順)
雨堤俊次 バッジ画像
2023/12/06 17:42

今更なんですけど、これ「教えて専門家」のほうが良かったのでは……?


確かに「教えて専門家」でも良いかもしれませんね!

今回、1つのベストアンサーに絞りたいというよりは雑談ベースで、使ってみた人たち同士の交流もふくめてディスカッション生まれると良いなと思って、トーク部屋に投稿させていただきました!

雨堤俊次 バッジ画像
2023/12/06 21:11

なるほど、それは確かに

犬派
2023/12/06 08:49

修士まで大腸菌のtRNAやrRNAの研究をしていましたが、このツールは非常に有用だと感じました。

実際に研究していた遺伝子名で検索してみると当時の実験手法とは別の方法でRNAのメチル化を検出していたり、その遺伝子をKOした際に大腸菌で起きる変化(生育遅延)とマウスで起きる変化(不安様症状や記憶障害)に差があるなど新たな知見を得ることができました。

ヒト遺伝子名での検索という若干の制約はあるものの、ヒトや大腸菌で共通している・類似している遺伝子は非常に多い為(むしろ重要な遺伝子ほど共通しています)実験で扱う生物種に限らず利用できると思います。


ありがとうございます!
差し支えなければ、コミュニティからの声も、ページに反映させていただければと思います!